波波维奇上任的第一件事就是要找到接替约翰·卢卡斯的主帅，起初他把目标定在了勇士主帅老尼尔森身上。但勇士老板拒绝放人，这次主帅邀请未能成功。
鲍勃·希尔担任过步行者和尼克斯的主帅，当时处于黑白双煞、坏小子军团和乔丹三连冠时期，未能有任何成绩，临时救火，成了波波维奇治下的首位主帅。鲍勃·希尔的首个带队赛季战绩还不错，马刺在1994-95赛季打出62胜20负战绩，刷新队史胜场记录。
大卫·罗宾逊当选为常规赛mvp并入选最佳防守阵容一阵，不过那个赛季的季后赛，大梦奥拉朱旺发威，让上将直接沦为了软蛋。赛季结束以后，波波维奇送出丹尼斯·罗德曼，从公牛得到了中锋威尔·普度。
1995-96赛季，马刺常规赛战绩为59胜23负，西部半决赛，马刺六场不敌犹他爵士，止步次轮。
1996-97赛季，马刺遭遇重大伤病潮，开局战绩不佳，带队打出3胜15负的鲍勃·希尔下课，波波维奇成为了球队主帅。那个赛季大卫·罗宾逊仅出战6场，马刺常规赛战绩为20胜62负，如愿在夏天拿到状元签。
马刺用这枚状元签，摘到了维克森林大学的蒂姆·邓肯。
传闻称，红衣主教奥尔巴赫曾寻求交易到邓肯，筹码随便波波维奇挑选，不过被直接拒绝。奥尔巴赫随后不再过问凯尔特人事，退到了二线。
1997-98赛季，大卫·罗宾逊复出和邓肯组成了实力强劲的双塔组合，马刺队从上个赛季的20胜直接提升到56胜，邓肯无悬念的拿到年度最佳新秀。第二轮季后赛，邓肯在第二场时扭伤脚踝，马刺1-4被犹他爵士淘汰。
这个赛季结束后，如日中天、两次三连冠封神的迈克尔·乔丹第二次退役。
1998-99赛季，nba因劳资纠纷出现停摆，常规赛由82场缩水到了50场。马刺开局只打出6胜8负的战绩，主教练波波维奇受到质疑，不过邓肯和大卫·罗宾逊都站出来力挺主帅，随后的比赛中，马刺打出31胜5负的战绩。
马刺季后赛的状态神勇无比，首轮3-1战胜加内特的森林狼，次
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